Skryptowalna aplikacja Java do przetwarzania obrazów naukowych
ImageJ to program do projektowania graficznego oparty na Javie, dedykowany do analizowania obrazów który można zainstalować bezpłatnie na kompatybilnych komputerach stacjonarnych z systemem Windows. Może działać jako applet online lub jako aplikacja do pobrania. Co ważniejsze, to narzędzie do fotografii umożliwia wyświetlanie, edytowanie, analizowanie, przetwarzanie, zapisywanie i drukowanie zdjęć 8-bitowych, 16-bitowych oraz 32-bitowych.
Nie wspominając o tym, że obsługuje również najpopularniejsze typy plików graficznych, w tym TIFF, GIF, JPEG, BMP, PGM, DICOM, ASCII, FITS oraz pliki danych surowych w formatach tekstowych, takich jak arkusze kalkulacyjne. ImageJ może być znaczącą alternatywą dla Image Analyzer firmy Meesoft i JPEGsnoop Calvina Hassa.
Do czego służy ImageJ?
Głównym celem ImageJ jest obliczanie powierzchni i wartości pikseli , co będzie niezwykle przydatne dla projektantów graficznych. Jednak wykracza to nieco poza to, umożliwiając pomiar odległości i kątów, tworzenie histogramów gęstości oraz wykresów profilu linii. Ponadto, oferuje inne standardowe funkcje przetwarzania obrazów , takie jak manipulacja kontrastem, wyostrzanie, wygładzanie, wykrywanie krawędzi i filtracja medianowa, aby wymienić tylko kilka. Transformacje geometryczne takie jak skalowanie, obrót i odbicia mogą być również wykonywane za pomocą tego narzędzia do zdjęć cyfrowych.
Funkcja przetwarzania kolorów w ImageJ jest potężna i wszechstronna, umożliwiając przeprowadzanie szeregu analiz i modyfikacji opartych na kolorze w obrazach. W szczególności obsługuje kilka przestrzeni kolorów, w tym RGB, HSB i CIE Lab, co pozwala na precyzyjne przetwarzanie obrazów w zależności od potrzeb analizy. To oprogramowanie umożliwia separację kolorów, pozwalając na podział obrazu na poszczególne kanały kolorów, które można następnie modyfikować oddzielnie.
Oparte na Javie oprogramowanie do przetwarzania obrazów może obsługiwać stosy obrazów—wielowątkową serię obrazów, które dzielą jedno okno. Dzięki temu można przeprowadzać czasochłonne operacje równolegle na sprzęcie wieloprocesorowym. Automatyzuj zadania i twórz niestandardowe narzędzia za pomocą preinstalowanych makr. Może generować kod makr za pomocą rejestratora poleceń, a korzystanie z debuggera makr pozwoli na jego debugowanie. W aplikacji dostępnych jest ponad 300 makr do wykorzystania oraz ponad 500 pluginów dostępnych.
ImageJ vs. Fiji
Dla porządku, Fiji jest jak ImageJ , ale opiera się na ImageJ2—całkowitym przepisaniu pierwszej wersji dla danych obrazów wielowymiarowych. Rozwój Fiji ma na celu dostarczenie dystrybucji ImageJ2 z wieloma zintegrowanymi wtyczkami. Integruje system aktualizacji, który generuje uporządkowaną strukturę menu i wszechobecną dokumentację, dostarczając szczegółowe opisy algorytmów i samouczki. Wiele osób poleca Fiji zamiast ImageJ, szczególnie dla użytkowników zajmujących się naukami przyrodniczymi, ponieważ jest wyposażone w wtyczkę Bio-Formats.
Bio-Formats znacznie ułatwi otwieranie większości zastrzeżonych formatów plików, które dostawcy mikroskopów używają do przechowywania obrazów. Na przykład, widok 3D który implementuje rejestrację, segmentację i inne zaawansowane algorytmy przetwarzania obrazów za pomocą mikroskopii świetlnej, może lepiej wizualizować dane. Komponent TrakEM2, który zawiera, został skutecznie wykorzystany i ulepszony do analizy linii neuronalnych w mózgach larw Drosophila. Fiji umożliwia Ci unikanie potrzeby instalowania wielu komponentów z różnych źródeł.
Dobry analizator obrazów
ImageJ to przyzwoite i smukle rozwiązanie do analizy obrazów. Ładuje się i działa znacznie szybciej oraz jest łatwiejsze dla użytkowników nieprogramistów w obsłudze. Ponieważ składa się z funkcji „Kompiluj i Uruchom” dla wtyczek bez konieczności uczenia się systemu zarządzania kodem. Ale, jeśli pragniesz lepszego przetwarzania, które również zapewnia więcej wbudowanych makr i wtyczek, Fiji będzie lepszą opcją, szczególnie jeśli jesteś w dziedzinie nauk przyrodniczych.
